使用Frp进行内网穿透
如果你的自建服务器在内网,没有一个公网可以访问的IP地址,不要慌,只要随便找一个能从公网访问的服务器,跟着流程走就可以了。如果确实没有,那就从云服务商那里薅一点便宜羊毛,买那种最便宜的服务器(哪怕是1U2G的规格都可以,只要有个公网IP就行),然后照着来就行。 ...
初始化你的Linux服务器
刚装好的Linux系统可能什么软件也没有,时区也不对,也没办法访问外网,下面让我们一个一个解决这些问题。 常用配置和依赖项安装(必备) 对于Ubuntu,你最好的软件管理方案就是apt,先来更新它一下 ...
从裸机开始搭建一台Linux服务器
家里有一台PC,之前本来做游戏主机用的,但是闲置了。加上最近有一些用服务器需求,看了一下阿里云上看得过去的服务器租用价格怎么也得几百,于是想了想还是打算利用一下这个闲置机器自己搞一搞。 ...
ggplot2 函数式批量作图
以处理Seurat对象为例 Seurat内置的函数作图出的图对象都是ggplot类型的对象,所以全都可以用ggplot2的方法进行图的格式修改。 对于一个常见的seurat作图函数,一般函数内部会有一些参数可供修改: ...
Seurat处理
环境配置 新版的Seurat有处理空间转录组数据的功能,所以就顺手用一下子。 IDE就用Rstudio,相关包安装就用Rstudio自带的就行了。主要是seurat本体 + ggplot + patchwork这几个,另外还需要dplyr和stringr。 ...
数据预处理和官方Pipeline
我分析的是空间转录组数据,所以下面以10x Fresh Frozen空间转录组数据为例。 集群搭建与环境配置 实验室暂时没有服务器,租了阿里云服务器。实例规格ecs.r6.4xlarge,16核CPU,128G内存,这个规格后续被证明是刚好够用且好用的。 ...
eDiary——实验记录利器
工欲善其事,必先利其器。做好实验记录是养成良好实验习惯的一个必不可少的部分。然而,用纸笔记录实验过程稍显繁琐,且不易复制,还是电子化的记录比较贴近这个时代。 ...